Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mtatp6P00848 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms