Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CopeO89079 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CopeO89079 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CopeO89079 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CopeO89079 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CopeO89079 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CopeO89079 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CopeO89079 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms