Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CpdO89001 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CpdO89001 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CpdO89001 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CpdO89001 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CpdO89001 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CpdO89001 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CpdO89001 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CpdO89001 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CpdO89001 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CpdO89001 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CpdO89001 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CpdO89001 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CpdO89001 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CpdO89001 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CpdO89001 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CpdO89001 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CpdO89001 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CpdO89001 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CpdO89001 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CpdO89001 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CpdO89001 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CpdO89001 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms