Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MscO88940 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MscO88940 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MscO88940 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MscO88940 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MscO88940 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MscO88940 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms