Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F11rO88792 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F11rO88792 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F11rO88792 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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F11rO88792 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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