Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops6O88545 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cops6O88545 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cops6O88545 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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