Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl22O88430 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms