Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vti1bO88384 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vti1bO88384 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms