Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnnal1O88327 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnnal1O88327 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms