Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nid2O88322 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nid2O88322 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nid2O88322 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms