Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmb5O55234 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb5O55234 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms