Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChkbO55229 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChkbO55229 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms