Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rpl35aO55142 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rpl35aO55142 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl35aO55142 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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