Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif6O55135 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif6O55135 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms