Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mmp10O55123 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mmp10O55123 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp10O55123 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms