Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrxO55103 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PrxO55103 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrxO55103 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrxO55103 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrxO55103 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrxO55103 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrxO55103 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrxO55103 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrxO55103 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrxO55103 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrxO55103 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrxO55103 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrxO55103 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrxO55103 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrxO55103 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms