Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SlkO54988 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SlkO54988 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SlkO54988 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SlkO54988 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SlkO54988 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SlkO54988 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SlkO54988 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SlkO54988 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SlkO54988 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms