Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema6bO54951 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6bO54951 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema6bO54951 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms