Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh16O54909 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh16O54909 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh16O54909 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16O54909 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16O54909 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16O54909 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16O54909 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16O54909 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16O54909 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16O54909 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16O54909 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms