Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb3O54890 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb3O54890 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms