Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Limk2O54785 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms