Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin1O54724 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cavin1O54724 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms