Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klrk1O54709 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klrk1O54709 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klrk1O54709 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klrk1O54709 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms