Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EdaO54693 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EdaO54693 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EdaO54693 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EdaO54693 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EdaO54693 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EdaO54693 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EdaO54693 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms