Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr6O54689 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr6O54689 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr6O54689 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr6O54689 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr6O54689 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr6O54689 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr6O54689 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr6O54689 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr6O54689 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms