Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdc4O35988 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdc4O35988 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms