Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NudcO35685 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NudcO35685 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NudcO35685 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NudcO35685 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NudcO35685 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NudcO35685 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NudcO35685 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NudcO35685 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms