Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1mwO35599 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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