Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd2O35392 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms