Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn1O35350 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn1O35350 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn1O35350 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn1O35350 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn1O35350 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms