Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dgcr6O35347 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dgcr6O35347 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms