Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms