Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ebi3O35228 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms