Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RrhO35214 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RrhO35214 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RrhO35214 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RrhO35214 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RrhO35214 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RrhO35214 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms