Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarb2O35114 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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