Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih2O35089 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms