Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArxO35085 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArxO35085 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArxO35085 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArxO35085 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArxO35085 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArxO35085 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArxO35085 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArxO35085 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArxO35085 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArxO35085 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArxO35085 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArxO35085 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArxO35085 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArxO35085 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms