Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-Q1O19441 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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H2-Q1O19441 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-Q1O19441 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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