Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq1O09165 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq1O09165 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casq1O09165 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casq1O09165 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casq1O09165 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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