Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb1O09061 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb1O09061 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms