Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gfra2O08842 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms