Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CckarO08786 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckarO08786 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckarO08786 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckarO08786 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckarO08786 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckarO08786 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms