Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MttpO08601 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MttpO08601 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MttpO08601 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MttpO08601 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MttpO08601 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MttpO08601 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MttpO08601 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MttpO08601 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MttpO08601 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MttpO08601 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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