Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltaO08585 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CltaO08585 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltaO08585 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltaO08585 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CltaO08585 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltaO08585 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltaO08585 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CltaO08585 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltaO08585 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms