Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8050L7N2E3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8050L7N2E3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms