Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC117090L7N257 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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BC117090L7N257 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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