Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp955bL7N232 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms