Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm379J3QQ19 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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