Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10428J3QNV7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm10428J3QNV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm10428J3QNV7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10428J3QNV7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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