Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim34bJ3QNR8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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